康复理疗师的证书是由中国政府相关部门进行管理和发放的，在中国，主要负责这一工作的机构是中国人力资源和社会保障部（简称“人社部”）及其授权的职业技能鉴定指导中心，中国卫生健康委员会也会在一定程度上参与对康复理疗行业的规范和管理。

具体流程通常是：个人需要参加由官方认可的培训机构提供的康复理疗专业培训，并通过考核，将获得的培训合格证明提交至所在地的人社部门或其指定的考试中心，申请参加国家职业资格考试，通过考试后，便可获得由人社部颁发的康复理疗师职业资格证书，这个证书是全国通用的，对于从业者来说，是从事康复理疗工作的重要凭证。

行业协会如中国康复医学会等也会提供相关的专业认证，这些认证虽然非强制性，但能进一步提升康复理疗师的专业素质和市场竞争力。

值得注意的是，随着我国对健康服务业的重视程度不断提高，相关法规和管理制度也在不断更新和完善，在申请和获取康复理疗师证书的过程中，应密切关注最新的政策动态，以确保信息的准确性和有效性，成为合法合规的康复理疗师，既需要专业的知识和技能，也需要遵守严格的行业规定和法律法规。