在中国，理疗师证书的颁发主要由国家卫生健康委员会和人力资源和社会保障部主导，具体来说，理疗师的职业资格认证主要分为两个部分：职业技能鉴定和专业技术人员职业资格考试。

职业技能鉴定主要是针对在医疗机构、康复中心、健身中心等场所从事物理治疗工作的人员，这部分的证书通常由各地的人力资源和社会保障局或者其授权的机构进行考核并颁发，中国就业培训技术指导中心会组织全国统一的“康复理疗师”职业技能鉴定考试，通过者将获得相应级别的职业资格证书。

专业技术人员职业资格考试则主要面向在医疗系统内，如医院、诊所等地方工作的理疗师，这类考试通常由国家卫生健康委员会及其下属的各类专业学会或协会组织，比如中国康复医学会等，通过考试后，可以获得“康复医学专业技术人员”等相关职业资格证书。

还有一些教育培训机构或者行业协会也会提供理疗师的相关培训，并颁发相应的结业证书或者行业认可证书，但这些证书并不具备法定的专业资质效力。

理疗师证的颁发机构较多，既有政府相关部门，也有专业学会和教育培训机构，但在选择培训和考证时，应优先考虑权威性和合法性，以确保所获证书能在行业内得到广泛承认，随着我国对健康服务业的重视，未来可能会有更严格的规范和统一的标准来管理此类证书的发放。