在当前的健康服务领域，康复理疗师作为一种专业技能人才，其职业资格认证的重要性日益凸显，中国卫生健康委员会（Ntionl Helth Commission, NHCM）作为我国卫生工作的主管机构，对包括康复理疗师在内的各类医疗卫生人员的资质认定负有重要责任。

康复理疗师证书的颁发主要由以下几个部门或单位负责：

1、国家卫生健康委员会：这是最直接的颁发部门，它通过制定相关政策和标准，对全国范围内的康复理疗师进行职业资格认证，国家卫生健康委员会的职业技能鉴定指导中心会组织相关的考试和评审，合格者将获得由该委员会颁发的康复理疗师证书。

2、各级人力资源和社会保障局：依据《中华人民共和国劳动法》的规定，他们也参与职业技能的鉴定工作，其中包括康复理疗师的资格认证。

3、专业协会和学会：如中国康复医学会等，这些专业机构根据自身的行业规范和标准，也会对康复理疗师进行专业能力的评估与认证，颁发相应的专业资格证书，虽然不是法定的执业证书，但在行业内具有很高的认可度。

4、高等教育机构：部分医学院校和职业学院设有康复治疗技术等相关专业，学生毕业后，学校会提供相关专业的毕业证书，但这并不等于职业资格证书，还需要通过相关部门的考核获取。

值得注意的是，近年来，中国政府为了提升康复理疗服务质量，对康复理疗师的资质要求越来越严格，所有从事康复理疗工作的人员必须持有有效的职业资格证书，无论是个人还是机构，都应确保从正规渠道获取并维护好自己的康复理疗师资格证书。