在中国，卫生部门认可的按摩师证书主要有以下几种：

1、国家职业资格证书：这是由人力资源和社会保障部颁发的职业技能等级证书，按摩师被划分为五个级别，从初级到高级，每个级别的考试都有其特定的要求和标准，通过考核后，可以获得相应的国家职业资格证书，这是行业内最权威、最广泛接受的认证。

2、中医推拿按摩师证书：该证书是由中国针灸学会或者相关中医药教育机构颁发的，主要针对的是运用中国传统医学理论进行按摩治疗的专业人员，获得这个证书的按摩师通常具有深厚的中医理论基础和实践能力。

3、康复理疗师证书：对于在医疗机构从事康复按摩工作的专业人员，他们需要持有卫生部门认可的康复理疗师证书，这类证书通常要求持证者具备一定的医学背景知识，能够配合医生进行康复治疗。

4、保健按摩师证书：这种证书主要面向非医疗场所的按摩服务提供者，如SPA中心、美容院等，它强调的是按摩的休闲放松功能，而非治疗疾病，此类证书由各地劳动和社会保障局或相关培训机构颁发。

5、国际认证：例如CIDESCO（国际美容与身体疗法组织）提供的按摩师认证，虽然不是由中国卫生部门直接颁发，但因其全球范围内的认可度，也被很多专业人士所追求。