宠物营养师资格证书，作为一种专业技能认证，其权威性和合法性对于从事宠物护理、饲养以及相关行业的人来说至关重要，关于这个证书是否由国家直接发放，需要具体分析。

我们需要明确的是，在中国，职业资格证书体系主要分为两类：一类是由国家人力资源和社会保障部（简称“人社部”）主导并颁发的职业资格证书，这类证书具有全国性的权威性，例如心理咨询师、教师资格证等；另一类则是行业协会或专业机构自行设立并颁发的专业能力证书，比如宠物营养师、瑜伽教练等。

在当前的政策环境下，部分职业技能并未纳入国家统一的职业资格目录中，宠物营养师的资格认证可能并不由国家直接发放，而是由一些有影响力的行业协会或者专业的教育培训机构来提供和颁发，这些机构通常具备丰富的行业经验和专业知识，能够为学员提供系统的学习课程，并通过考核来确认其专业水平。

尽管如此，这并不代表这些非国家颁发的证书不具备价值，许多企业和雇主在招聘时也会认可这些专业机构颁发的证书，尤其是在新兴行业如宠物护理领域，这样的专业证书往往能证明持证者具备了相应的专业知识和技能。

关于宠物营养师资格证是否由国家发的问题，答案取决于具体的发证机构和国家的相关政策，但无论证书的来源如何，重要的是该证书所代表的知识和技能能否满足行业需求，帮助从业者提升专业素质，这也是选择接受培训和获取证书的主要目的，国家也鼓励和支持行业协会和专业机构进行更高质量的职业技能培训，以适应社会发展的需求。