心理咨询师证书的发放机构主要由中国国家人力资源和社会保障部（简称“人社部”）及其授权的单位进行，在中国，心理咨询行业的发展与规范是由政府主导并逐步完善的。

心理咨询师的职业资格认证属于国家职业资格目录中的水平评价类职业资格，由人社部统一管理，获得此证书的人员表明其具备了从事心理咨询工作的专业技能和知识，符合国家对心理咨询行业的专业要求。

具体的培训和考试工作一般由各地的人力资源和社会保障局或其指定的培训机构负责实施，这些机构需要经过严格审批，确保其教学质量和课程内容符合国家规定，考生在完成规定的培训课程并通过严格的理论和实操考核后，才能获得由人社部颁发的心理咨询师职业资格证书。

值得注意的是，随着国家对于职业资格证书制度的改革，部分职业资格许可和认定事项已经取消，但心理咨询师作为专业技术人员的重要证明，其证书仍然具有很高的权威性和实用性，而且，虽然取消了一些行政许可，但行业内的专业标准和能力要求并未降低，反而更加注重实践能力和继续教育。

心理咨询师证书的发证机关是中国国家人力资源和社会保障部，具体的考试、培训和证书发放则由各地的人社部门及授权机构执行，这一体系旨在保证心理咨询行业的专业性、科学性和有效性，为公众提供高质量的心理咨询服务。