中医针灸理疗师证书是由中国政府相关机构颁发的，在中国，这一权威证书主要由人力资源和社会保障部（原劳动和社会保障部）以及中国针灸学会等专业组织进行考核和发放。

人力资源和社会保障部是负责全国人力资源和社会保障工作的国务院组成部门，其下设的职业技能鉴定中心负责各类职业技能资格的认定与证书发放工作，对于中医针灸理疗师这样的专业技能人才，他们会依据《国家职业分类大典》中的规定，设定相应的考试标准和流程，对申请者进行理论知识和实际操作能力的全面考核，合格后颁发相应等级的中医针灸理疗师职业资格证书。

中国针灸学会作为我国针灸医学领域的专业学术团体，也在推广和发展中医针灸事业中起到了重要作用，他们也会举办各种培训课程，并对完成学习且通过考核的学员颁发结业证书或专业技能证书，这些证书在行业内也有很高的认可度。

中医针灸理疗师证书的颁发不仅需要专业的技术知识和临床实践经验，还需要通过严格的考试和评估，确保每一位持证人具备扎实的专业素养和良好的职业道德，以提供高质量的中医针灸服务，保护患者的健康权益，这也体现了中国政府对中医药事业的高度重视和规范管理，旨在推动中医针灸的健康发展，传承并发扬这一中华瑰宝。