心理咨询师证书的发放机构主要由国家人力资源和社会保障部以及中国心理卫生协会共同负责，在中国，心理咨询行业的发展和规范主要依据的是《中华人民共和国职业分类大典》和相关的职业技能鉴定规定。

国家人力资源和社会保障部是中国政府主管全国人力资源和社会保障工作的部门，它对包括心理咨询师在内的各类职业技能进行宏观管理和指导，根据国家政策，心理咨询师被列为专业技术人员序列，其职业资格认证工作就落在了人力资源和社会保障部的肩上，通过设立统一的考试标准、组织考试及认定合格者颁发相应级别的心理咨询师证书，以此来确保行业的专业性和规范化。

中国心理卫生协会作为我国心理学界的权威机构，也在心理咨询师证书的发放中起到重要作用，它是经民政部批准成立的全国性社会团体，致力于推动我国心理健康事业的发展，提高公众的心理素质，在实际操作中，中国心理卫生协会会与各地的心理咨询师培训和考核机构合作，对学员进行专业的理论和实践培训，并协助实施心理咨询师的职业技能鉴定，以确保心理咨询师的专业能力和服务质量。

总结来说，心理咨询师证书是由国家权威部门和专业行业协会联合发放的，旨在保证心理咨询行业的专业水平和职业操守，为公众提供高质量的心理咨询服务，对于想要从事这个行业的人来说，获取这一证书不仅是对其专业能力的认可，也是进入心理咨询领域的重要凭证，持证上岗也能让服务对象更放心，促进整个行业的健康发展。