心理咨询师证书的颁发部门是中国人力资源和社会保障部（简称“人社部”）以及中国心理卫生协会，这两个机构在心理咨询领域具有权威性和专业性。

中国人力资源和社会保障部是中华人民共和国国务院组成部门，主要负责全国的人力资源开发、社会保障等事务，其下设的职业技能鉴定中心负责各类职业技能的鉴定工作，包括心理咨询师的职业资格认证，通过考试并达到相应标准的考生，可以获得由人社部颁发的心理咨询师职业资格证书，这是国家对个人从事心理咨询工作的官方认可。

中国心理卫生协会则是由心理学专业人士自愿组成的全国性学术团体，其任务是推动我国心理健康事业的发展，提高公众的心理健康水平，促进心理咨询行业规范化，该协会与政府相关部门合作，制定行业规范，提供专业培训，并参与心理咨询师的资质认定，虽然它不是直接颁发证书的政府部门，但其出具的心理咨询师专业资格证书，在行业内同样享有高度的认可度。

两者结合，确保了心理咨询师的专业素质和职业能力得到全面、公正的评估和认证，维护了行业的健康发展，也为社会提供了高质量的心理咨询服务，心理咨询师的证书颁发涉及到了既有政府职能的执行，又有行业协会的专业背书，充分体现了我国在心理咨询行业管理上的科学性和规范性。