心理咨询师的资格认证在中国主要由以下几个部门进行：

1、教育部：教育部认可的心理咨询专业教育机构，如大学和职业学院，提供心理学本科和研究生课程，完成这些课程并通过相关考试的学生可以获得心理咨询的基础理论知识和实践技能。

2、人力资源和社会保障部（原劳动和社会保障部）：该部门负责颁发国家职业资格证书，其中包括心理咨询师的职业资格认证，这个证书是全国通用的，对求职、晋升都有重要影响，申请者需要通过理论考试和实操考核，以证明他们具备了从事心理咨询工作的专业能力。

3、卫生健康委员会：在某些情况下，心理咨询师可能被看作是医疗保健团队的一部分，因此他们的认证可能也与卫生健康部门有关，一些医院或诊所的心理咨询服务可能会要求心理咨询师持有相关的医疗或心理健康服务的资质。

4、中国心理学会：这是一个专业的学术组织，虽然它不直接颁发官方的职业资格证书，但其会员资格在行业内具有很高的权威性，加入中国心理学会通常需要一定的学历背景、研究经验和专业贡献。

5、国家心理咨询师协会等行业协会：这类非政府组织也会提供心理咨询师的培训和认证，尽管它们的证书可能不如政府部门的权威，但在特定行业或地区内，也可能受到雇主和客户的高度认可。

每个部门的认证标准和流程可能存在差异，但都旨在确保心理咨询师的专业素质和服务质量，选择哪种途径获取认证，往往取决于个人的职业规划和目标。