食管反流手术属于微创手术。内镜下的微创治疗包括射频治疗，注射或植入技术以及内镜腔内胃食管成形术三类。抗反流外科手术治疗是指腹腔镜下胃底折叠术，可以有效的控制和酸反流相关的胃食管反流病。质子泵抑制剂治疗失败也是抗反流手术的适应症之一。有研究表明，腹腔镜下胃底折叠术能有效改善酸和弱酸反流，术后有较高的症状缓解率。正常认为PPI疗效欠佳的胃食管反流病病人手术治疗效果不如质子泵抑制剂治疗有效。不提倡对和症状无关的非酸反流者进行手术治疗，应当谨慎选择抗反流手术的病人。手术前应当进行评估，比如食管测压等除外，动力障碍性疾病。