跑步后脚踝疼可能是运动过程中不小心局部的地方扭伤了，也可能是局部本身存在骨关节炎，运动后加重病情了，可以考虑及时拍膝关节的X片了解病情，局部的地方若是骨关节炎可以考虑吃些氨基葡萄糖，关节腔可以注射玻璃酸钠，若是扭伤了韧带，暂时不宜参加运动，需要休息差不多三四周的时间，局部可以泡热水，喷洒肿痛气雾剂利于改善的。