跑步之后小肚子疼痛造成的原因有很多种，有可能在跑步的过程当中，由于呼吸进入凉空气会造成小肚子疼痛，或者是有一些女性有盆腔炎，附件炎，输卵管炎这一类的疾病，在跑步的时候会牵涉性的造成疼痛的感觉，这需要做B超检查确定，确定有炎症感染之后，应当及时的用抗生素进行治疗。可以用妇科千金片配合甲硝唑或者左氧氟沙星治疗。