胃蛋白酶原有2种，在胃黏膜不同形态和状态下，两种物质水平是不一样的，胃酸分泌增多，胃蛋白酶原Ⅰ会上升；当胃黏膜性萎缩病变，胃酸减少，胃蛋白酶原Ⅰ就会降低。但就Ⅱ而言，它的升高和胃底腺管萎缩、异型增生等有关。临床上常常监测二者比值，可用于胃癌初筛。