肺脓肿是由化脓性病原体引起肺组织坏死和化脓，导致肺实质局部区域破坏的化脓性感染。化脓性病原体进入肺内有几种途径，最主要的途径是口咽部内容物的误吸。1、呼吸道误吸，口腔、鼻腔、口咽和鼻咽隐匿着复杂的菌群，组成口咽的微生态环境，这些菌群包含了很多厌氧菌，误吸后肺脓肿形成的可能性取决于吸入量、细菌数量、吸入物的pH和患者的防御功能。2、血液循环途径，其它部位感染灶内部的厌氧菌经血液循环播散到肺引起肺脓肿。3、其它途径，慢性肺部疾病者、肺内本身有空洞、临近器官播散、污染的呼吸道装置、先天性肺异常疾病的继发感染等。
