其主要的临床传播途径是内源性感染，即吸入患者自身的口咽分泌物中的细菌，这是主要的传播途径。他的气溶胶是分泌性的，如果和患者接触，也会造成肺炎克雷伯菌感染。如果临床上接触患者的排泄物，也会发生感染。此外还有医务人员的手部，也是造成肺炎克雷伯氏菌传播的主要途径。