肠胃不舒服的检查方法有：1、胃镜及肠镜是胃肠道检查的首选方法，同时准确率非常高。在胃镜和肠镜下可以看清黏膜是否有溃疡、出血、占位性病变等，还可以做病理检查。2、可以进行碳13或碳14吹气试验，检查是否有幽门螺旋杆菌的感染。3、还可以抽血进行胃肠道肿瘤标志物的检查。4、腹部彩超、x线钡餐检查都对胃肠道疾病有一定的效果。要根据个人的需求来选择合适的检查方法。