肠系膜脂膜炎的治疗首先要针对原发疾病进行正规的治疗。比如很可能是继发于系统性红斑狼疮，或者系统性硬化病等的自身免疫性疾病而表现出的，因此要积极治疗原发病。需要应用糖皮质激素，联合免疫抑制剂共同治疗，比如可以选用羟氯喹或者环磷酰胺等， 也可以应用非甾体抗炎药缓解症状。