肠炎经过规范系统的治疗，基本都可以完全治愈。但是有一部分的肠炎，经过治疗之后可能呈慢性病发展，表现为反复的发作，相当影响病人的生活质量。例如炎症性肠病，比如克罗恩病经过治疗之后，往往会呈慢性的病程，反复发作。此外，放射性肠炎要是急性期控制不好，也可能会发展为慢性放射性肠炎，反复表现出症状，并且预后较差，降低病人的生活质量。