药物治疗与心理治疗的联合应用，是治疗神经官能症的最佳办法。一般来说，药物治疗对于神经官能症的症状是有效的，但由于神经官能症的发生与心理因素、社会应激因素以及个性特征等有着密切的关系，因此还需要进行心理治疗。而且成功的心理治疗可能更重要，它不但可以缓解症状，还可能根治部分的患者。心理治疗方法的选择，取决于患者的人格特征、疾病类型以及治疗者对某些心理治疗方法的熟练程度与经验。药物治疗有很多，主要为对症治疗，比如抗焦虑药物治疗、抗抑郁药物治疗以及促进大脑代谢的药物治疗等。