主要区别是部位不同，牛蒡子主要是果实，而牛蒡根是牛蒡的根。牛蒡根能够起到清热解毒以及去风湿作用，当表现出咳嗽或者体内有水肿情况时，可以适当吃一些，能有效缓解症状。而牛蒡子主要是疏风散寒功效，当表现出风热感冒或者是嗓子疼痛等表现时，可以使用牛蒡子冲水喝，能有效改善症状。