来月经时头痛，是由于月经期血清中的雌二醇浓度降低，造成颅内外血管及子宫血管对某些因素物质更敏感，因此造成血管张力的变化发生头痛。月经结束后，雌二醇水平恢复正常，患者的头痛会缓解。所以月经性头痛常随月经周期的表现出而表现出，随着月经的结束而消失。还有一种可能是雌激素刺激泌乳素分泌，间接刺激前列腺素分泌，而前列腺素作用于血管，造成血管收缩扩张造成偏头痛。