杀幽门螺旋杆菌的药物，主要为广谱的抗生素。而抗生素的副作用较多，主要包括有几个多见的方面：第一，消化道刺激症状，比如恶心、腹胀、腹痛等。第二，过敏反应，比如皮肤红疹、红斑、瘙痒等，严重者还可以表现出过敏性休克。第三，肝肾功能损害，比如药物性肝炎、药物性肾炎等。第四，神经系统损伤，比如损伤听力、头晕头疼等。