无创DNA和羊水穿刺最根本的区别是无创是属于产前筛查技术，羊水穿刺是属于产前诊断技术。两者的检查方法也不同，无创使抽取孕妇外周的血液检查，是一种没有创伤的检查方法。羊水穿刺检查需要抽取羊水，是一种有创伤的检查，也会造成流产，感染的风险。还有检查的时间也不同。