扁桃体结石的主要临床症状是喉咙痛，吃东西时会有明显的梗阻感。由于病变主要位于喉部附近，可能造成附近其他器官疼痛，如耳廓不规则疼痛，伴随唾液分泌增多。同时由于喉部结石的存在，部分病人会表现出严重口臭。平时注意保持口腔卫生，勤刷牙，勤用盐水漱口。如果扁桃体隐窝可见囊肿或结石，可经常在隐窝口清洗囊肿和结石，或简单地用生理盐水冲洗。病情严重者，应同时行扁桃体切除术。