恩替卡韦和替诺福韦都是慢乙肝治疗的首选药物，抗乙肝病毒的效果都不错，但替诺福韦的耐药发生率相对较低，若是初次抗病毒治疗，需要根据病人年龄、乙肝病毒定量综合考虑药物选择。若是核苷（酸）类药物应答不佳或耐药的病人，就要根据之前所用药物来判断，如拉米夫定应答不佳或耐药，就要选择替诺福韦；阿德福韦应答不佳或耐药，可以换用恩替卡韦，也可以换用替诺福韦等等。总之要视情况选择药物，不是单纯哪个抗病毒效果好的问题。