临床上对于幽门螺杆菌阳性的患者在以下情况下需要除菌治疗，首先建议患有消化性溃疡的患者，除菌治疗包括胃溃疡以及十二指肠溃疡。此外，有胃癌家族史或者一级亲属中有胃癌的患者，建议除菌治疗，同时患有胃黏膜淋巴组织相关淋巴瘤的患者也建议除菌治疗。此外，如果需要长期服用阿司匹林等抗血小板聚集的药物也建议除菌治疗。同时，对于不明原因的缺铁性贫血、过敏性紫癜等也需要积极除菌治疗。再次，对于患者强烈要求除菌的治疗时，也应除菌治疗。