妇科菌群失调有一少部分人没有临床症状，有症状的主要表现为阴道分泌物增多，有鱼腥臭味，尤其在性交后加重，可伴随轻度的外阴瘙痒或者烧灼感。检查可见分泌物的特点是灰白色，均匀一致，稀薄，常粘附在阴道壁，但粘度很低。妇科菌群失调所造成的混合感染就是细菌性阴道病，这种菌群失调主要是乳杆菌减少，其他的病原微生物大量繁殖导致的。