原发性痛经和继发性痛经最主要的区别是体内有无器质性病变；原发性痛经多见于青少年女性，在月经初潮后2年左右出现痛经，与遗传，营养以及环境有关，通过药物治疗多会好转，甚至部分患者在生育后会自愈。 而继发性痛经多见于育龄期女性，多继发于子宫内膜异位症、子宫腺肌症、子宫肌瘤等等器质性疾病，可先通过药物进行保守治疗，药物治疗无效的可在医师的指导下通过手术的方式进行治疗。