女性在月经停止40天时去医院进行腹部b超检查，没有看到孕囊，可能是因为女性发生宫外孕或生化妊娠流产等造成的，女性需要去医院进行抽血验hcg检查；还有可能是怀孕时间较短，还无法观察到孕囊造成的，可以在几天后再次进行检查。