一般来说肠镜检查是不会表现出什么副作用的，是很平常的检查。因为也是一种入侵性检查，若操作不当，也会对身体有一定的创伤，检查过程中可能会表现出疼痛不舒服的表现，也有可能损伤肠道粘膜，造成炎症和水肿，严重者甚至造成出血，穿孔等。如果是无痛肠镜，可能会表现出麻醉意外，但可能性很小。所以做检查前向医生详细了解，检查过程中积极配合，在检查中，检查后有任何不适，告知医生，以减少肠镜的痛苦和意外的发生。