胃蛋白酶原是胃粘膜细胞分泌的一种蛋白，是胃蛋白酶的前体，根据其生化特性和免疫原性将其分为2个亚群，1-5组成的免疫原性相同，称为胃蛋白酶原I，主要由胃底腺的主细胞和黏液颈细胞分泌。胃萎缩时会改变蛋白酶原的分泌，所以胃蛋白酶原I可作为胃粘膜萎缩的可靠指标。现阶段，胃蛋白酶原水平检测已被认为是“血清学上的胃镜检测”。