两侧肩胛骨内疼痛多见以下几种原因：第一、斜方肌以及菱形肌发生严重劳损，主要和颈肩部过度活动及负重有关，肌肉呈现僵硬紧张状态，按压时有明显疼痛症状，还会限制颈椎及肩胛骨活动。第二、胸椎关节功能紊乱，运动损伤、长时间低头以及睡眠姿势不当，均可以造成胸椎小关节发生微小错位，因此造成胸椎关节功能紊乱。患者会表现为背部疼痛并伴胸部后伸及旋转活动受限。