一上厕所肚子疼主要是因为大便刺激肠道平滑肌，造成其处于持续性的收缩、痉挛状态，拉完大便后肠道平滑肌就会松弛，疼痛症状可以缓解。一般患有胃肠功能紊乱的病人才会表现出这种症状，可以服用益生菌调理肠道菌群，改善胃肠功能紊乱。此外，患有急性肠胃炎、肠痉挛都会表现出上述症状，建议病人去医院化验大便常规，肠镜检查，明确大便时腹痛的具体原因后再进行治疗。