非萎缩性胃炎和萎缩性胃炎临床诊断鉴别在于，萎缩性胃炎，胃黏膜有萎缩，胃的粘液腺与分泌胃酸的细胞均有萎缩，所以胃消化酶和胃酸分泌都会有所减少，一般不会发展成溃疡，但有恶性的倾向；非萎缩性胃炎多有胃酸分泌增加现象，不加控制会引起胃、十二指肠球部溃疡等，但相对恶变率低。在临床症状上也有些分别，萎缩性胃炎消化不良症状明显；非萎缩性胃炎酸性症状多见。