肾结石虽然是一种良性疾病，但有时候可能堵塞尿路阻碍尿液的排出，造成疼痛、肾积水，可使肾脏实质受压萎缩，功能减退，严重的可能造成尿毒症甚至肿瘤。如果肾结石早期没有被重视，失去最佳治疗时机，最终会出现肾小管变性，坏死，肾萎缩变小，使肾功能下降或完全失效等。同时长期结石刺激肾粘膜，也有导致癌症发生的可能。