肠结核早期症状并不典型，会出现一些全身性非特异的症状表现，例如乏力，消瘦，发热以及盗汗等症状。也可能会有肺结核的表现，例如咳嗽，咳痰，胸闷和胸痛等。随着病情进展，患者会出现一些消化道的症状，例如腹部疼痛，多位于右下腹部或者肚脐周围，常为痉挛性阵痛，一般在进餐后加重，可伴有腹部压痛以及腹泻的症状。有时会出现右下腹部出现腹部包块，也可能有便血的症状。