肛瘘在病发前期，肛周部位可见脓包，叫做肛周脓肿，肛周脓肿破溃后，皮下组织形成纤维化的瘘管，就是肛瘘，肛瘘的主要症状是局部流脓，湿痒及疼痛。前期流脓较多，色黄而稠，粪臭味重，久而久之，脓液逐渐减少，时有时无，稀淡如水，如过于疲劳，则脓液增多，可有粪便流出。