首选药物为红霉素、罗红霉素或阿奇霉素，早期应用效果更好。青霉素、链霉素和磺胺药一般无效。
由于红霉素等抗生素有一定的副作用，所以，应该在医生指导下给使用，不可自行用药。咳嗽剧烈者可以用10％氯化铵、敌咳糖浆以及中药竹沥水等祛痰止咳药。
在生病期间，多休息，卧室内要保持空气新鲜。对支原体肺炎来说，最佳的室温是18～20℃，同时保持60％的空气湿度，以防呼吸道分泌物变干而不易咳出。做一些营养丰富而又易于消化的食物，且宜少量多餐，多饮水。由于支原体肺炎具有传染性，且容易复发，因此患病期间要注意隔离，治疗要彻底。
