扁桃体发炎主要有以下几个原因：1、营养不良或者免疫力系统遭到破坏的情况下免疫力下降，很容易被病原体侵入出现发炎现象。例如处于寒冷、潮湿的环境下，过度劳累，呼吸有害气体，免疫系统因抵抗此类诱发因素出现下降时，就会引起扁桃体发炎。2、扁桃体周围器官患有炎症诱发扁桃体发炎。例如急性咽炎、鼻炎、口腔炎症。3、出现细菌病毒感染。例如非溶血性链球菌、肺炎链球菌、流感病毒、弓形虫。