大多数肺炎支原体感染为临床显性感染而非隐性感染。大多数感染者仅累及上呼吸道。在经过2-3周，病情加重，表现发热、全身不适、头痛和咳嗽。咳嗽是肺炎支原体感染的特点，在随后的1-2天，咳嗽的频率和严重程度增加，可能会使患者衰弱。