扁平疣的治疗方法是比较多的，一般比较小的扁平疣可以使用药物治疗，药物治疗一般可以外用药物，比如咪喹莫特乳膏、维A酸类药物、五氟尿嘧啶软膏等药物涂擦。另外还可以采用激光，冷冻，电灼等物理方法治疗，还可以使用抗病毒的药物口服。如果想要一次性彻底治疗扁平疣建议还是物理治疗，比如用激光、冷冻等物理的办法去除疣体，这种方法是可以很快见效的。