甲状腺实质性病变，如甲状腺炎，手术或放射性同位素治疗造成的腺组织破坏过多，发育异常等。甲状腺素合成障碍，如长期缺碘、长期药物服用、先天性甲状腺素合成障碍、可能由于一种自身抗体引起的特发性甲状腺功能低下等。垂体或下丘脑病变，根据发病年龄不同。 甲减的治疗主要是药物治疗。