尖锐湿疣的治疗必须采用综合治疗。
1.治疗诱因（包皮过长、阴道炎、包皮龟头炎、淋病等）。
2.提高机体免疫力。
3.化学治疗
4.冷冻疗法
利用-196℃低温的液氮，采用压冻法治疗尖锐湿疣，促进疣组织坏死脱落，操作简便、高效，病人易耐受。本法适用于数量少，面积小的湿疣，可行1～2次治疗，间隔时间为一周。
5.激光治疗
通常用CO2激光，采用烧灼法治疗尖锐湿疣，对单发或少量多发疣体可行一次性治疗，对多发或面积大的疣体可行2～3次治疗，间隔时间一般为一周。
6.电灼治疗
采用高频电针或电刀切除湿疣。本疗法适应数量少，面积小的湿疣。
7.氨基酮戊酸光动力学疗法（ALA-PDT疗法）
本法可选择性杀伤增生旺盛细胞，不仅对肉眼可见的尖锐湿疣有破坏作用，还可清除亚临床损害和潜伏感染组织。具有治愈率高、复发率低、不良反应少且轻微、患者依从性好等优点。
8.手术治疗
适用于巨大尖锐湿疣，对疣体整个或分批切除。
9.免疫疗法
不主张单独使用，可作为辅助治疗及预防复发。可用干扰素肌内、皮下和损害基底部注射，白介素-2皮下或肌内注射，聚肌胞肌内注射等。
