根治尖锐湿疣主要还是看皮损的大小、数量、位置，以便能达到最好的治疗效果。症状较轻的患者通过药物即可治疗，如咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素乳膏、赛儿茶素软膏等，或通过皮损内注射干扰素治疗尖锐湿疣，但联合其他治疗使用更加有成效。其次，激光、电灼、冷冻、微波、手术等物理疗法也可通过清除皮损达到治疗效果。另外，如果皮损无法通过药物进行切除，患者也可进行手术治疗，但也有可能增加尖锐湿疣的扩散率，因此需要患者做出最佳选择。