一般情况下有少数的先心病类型可以自然的恢复，而有的却会随着年龄的增大，并发症会渐渐增多，变得更加严重。对于直径较小、无肺动脉高压的患者，可以观察到3～5岁再手术。如果是对血流动力学无明显影响的情况下，这种类型的甚至可以终身不需任何治疗，但如果是严重程度的，则要在出生后必须立即手术，否则患儿将无法生存。具体的手术方式包括根治手术、姑息手术、心脏移植等三类，根据患儿的情况再来选择。