治疗头癣的目标是清除真菌，避免感染扩散，使瘢痕的形成最小化。诊断一旦明确，不能仅外用药物治疗，还应口服抗真菌药物治疗。

灰黄霉素价廉，疗效好仍为治疗头癣的首选药物。而新的抗真菌药物，如特比萘芬、伊曲康唑、氟康唑治疗头癣疗效与灰黄霉素相近，但疗程短，且对儿童相对安全。服药3周后进行真菌镜检，如病发真菌镜检仍阳性，需延长疗程。以后每10~14天复查1次，连续3次阴性后方可认为治愈。