肾盂肾炎主要的治疗是以抗感染为主，常用药物为抗生素，包括头孢菌素类、半合成青霉素类、氟喹诺酮类等。一般对于急性期的肾盂肾炎，需要抗感染以及对症治疗。如果出现败血症现象，要给予静脉给药，并根据尿细菌的培养结果，用敏感的抗生素治疗。而对于慢性的肾盂肾炎，治疗原则是纠正和去除易感因素、抗感染等。如果出现肾脏瘢痕，就要用糖皮质激素和非甾体类抗炎药治疗。