第一、卵巢囊肿保守手术：包括开腹手术和腹腔镜下手术，手术的范围有分离患者的盆腔粘连，电灼或切除盆腔病灶，子宫悬吊术，卵巢内膜异位囊肿剥出术，合并有子宫肌瘤时同时切除，有严重痛经者，多主张将骶前神经切除。

第二、卵巢囊肿半保守手术：主要是切除子宫及子宫内膜异位病灶，保留卵巢功能。适用于45岁以下，并且无生育要求，或病灶的范围广泛，而且无法保留生育功能者，或合并有子宫肌瘤或子宫腺肌病者。