常用抗乙肝病毒治疗药物有：干扰素、拉米夫定、阿德福韦和恩替卡韦等四种。各有利弊，需权衡制宜使用。进行药物治疗的原则有：

1 病毒携带者，若肝功能正常不进行抗病毒治疗，若肝功能检查提示谷丙转氨酶为正常值两倍以上应进行抗病毒治疗;

2 注意因长期应用某个药物出现病毒变异而令药物失效的，注意整个疗程结束后的最初3个月每月监测一次肝功和乙肝病毒指标(HBeAg、HBVDNA)，此后延长监测时间。对于病情较重的肝硬化患者和疗效不好的患者，监测力度要加强，注意病情恶化;对于疗效较好者可以每半年或一年检查一次。